"Construir uma nação, com instituições sólidas e regime democrático como expressão de estrutura política, começa pela educação e se sedimenta, em definitivo, na educação"

( Marco Maciel )

A relação de mútua confiança que se estabeleceu entre Tancredo Neves e Marco Maciel, em todo o processo de transição, levou o presidente eleito a convidar Marco Maciel a integrar o eleito governo da Nova República, ocupando o ministério da Educação. Embora tenha permanecido no cargo apenas um ano, Marco Maciel realizou uma gestão revolucionária na pasta da Educação. Conseguiu que fosse regulamentada a Emenda Calmon, destinando, à época, 13% dos recursos orçamentários à Educação. Com essa medida o MEC passou a contar, a partir de 1986, com o segundo orçamento entre os ministérios. Foi dele, ex-presidente da União dos Estudantes de Pernambuco e do DCE da UFPe, a iniciativa de reconhecer a UNE e a UBES, tradicionais entidades estudantis de nível nacional, que desde os tempos do regime militar viviam na clandestinidade. Graças à sua iniciativa, o programa de distribuição do livro didático dobrou de 40 para 80 milhões de exemplares entre 1985 e 1986, o mesmo ocorrendo com a merenda escolar, cuja distribuição foi universalizada em todo o país e distribuída mesmo nas férias. Os programas "Nova Universidade", o de distribuição de material didático para professores do Nordeste, o "Educação para todos" e o do Ensino Técnico que deu início à construção das primeiras das 100 Escolas Técnicas então projetadas, são apenas algumas das iniciativas que consagraram sua passagem pelo MEC.

Convidado pelo presidente José Sarney, foi levado a exercer a coordenação política do governo na Casa Civil da Presidência da República. Lá Marco Maciel imprimiu o mesmo ritmo dinâmico que caracterizou sua passagem pelos cargos executivos por ele ocupados, tornando-se o articulador político do governo. Deixou o cargo em 30 de abril de 1987, para voltar a ser o Presidente Nacional do PFL, partido que fundara com expressivas figuras da política brasileira e se transformou no segundo maior do País.