Quando o médico suspeita de gastrite, ele deve investigar os hábitos alimentares, o uso de medicamentos, o consumo de bebidas alcoólicas e se o paciente tem outras doenças.

O diagnóstico de gastrite é confirmado pela endoscopia digestiva, em que o médico introduz um tubo fino pela garganta através do qual é possível enxergar a mucosa gástrica e colher fragmentos para exame (biópsia). Alguns sedativos podem ser usados para diminuir o desconforto durante a realização do exame.

No caso da H. pylori, a identificação da infecção pode ser feita no material obtido pela biópsia, por meio de um teste respiratório ou exame de sangue.