A intensidade dos sintomas depende das defesas do paciente e da capacidade do microorganismo de aderir às paredes do aparelho urinário. Os principais sinais de problemas urinários são:

- Dor ao urinar

- Ardência na uretra durante a micção

- Dificuldade para iniciar a micção

- Urgência de urinar

- Micções muito freqüentes e em pequenas quantidades

- Urina com mau cheiro ou coloração alterada

- Sangue na urina, que fica avermelhada ou acastanhada

- Dor na parte baixa do abdome, associada ou não ao ato de urinar

- Febre, calafrios, dor nas costas, náuseas, vômitos (quando a infecção é no rim)

Nas crianças os sintomas nem sempre são evidentes e podem incluir febre, falta de apetite, parada de crescimento e perda de peso.