A urina não deve conter microorganismos, cuja presença pode causar infecção urinária, caso da Escherichia coli, bactéria da flora intestinal que responde por cerca de 85% dos casos. Há alguns fatores que favorecem o acesso dos microorganismos ao aparelho urinário:

- Acúmulo de urina na bexiga por muito tempo

- Hábitos de higiene inadequados

- Gravidez, situação em que diminuem as defesas da mulher e aumenta a progesterona, hormônio que relaxa a bexiga, favorecendo a retenção de urina

- Climatério/menopausa: a probabilidade do surgimento da doença aumenta à medida que a mulher envelhece em razão das alterações hormonais

- Atividade sexual intensa, uso de diafragma, infecções anteriores, baixa imunidade

- Doenças sexualmente transmissíveis e infecções ginecológicas

- Obstrução urinária: qualquer fator que impeça o fluxo constante de urina, como aumento da próstata, defeitos congênitos, cálculos urinários ("pedra nos rins"), tumores

- Diabetes

- Corpos estranhos: a inserção de corpos estranhos, como sondas, pode carregar as bactérias para o sistema urinário

- Doenças neurológicas: interferem nos mecanismos de esvaziamento da bexiga, favorecendo a retenção de urina